基于类别保留投影的基因表达数据特征提取新方法

王文俊

doi:10.3969/j.issn.0372-2112.2012.02.024

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基于类别保留投影的基因表达数据特征提取新方法

科研通信 | 更新时间：2025-07-16

- 基于类别保留投影的基因表达数据特征提取新方法
- New Method of Feature Extraction for Gene Expression Data Based on Class Preserving Projection
- 电子学报 2012年40卷第2期页码：358-364
- 作者机构：
  
  1. 西安电子科技大学计算机学院,陕西,西安,710071
  2. 西安电子科技大学计算机学院陕西西安,710071
- 作者简介：
- 基金信息：
  
  中央高校基本科研业务费专项资金 (No.K5051203013)
- DOI：10.3969/j.issn.0372-2112.2012.02.024
  中图分类号： TP391
- 纸质出版：2012
- 稿件说明：
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王文俊. 基于类别保留投影的基因表达数据特征提取新方法[J]. 电子学报, 2012,40(2):358-364.

WANG Wen-jun. New Method of Feature Extraction for Gene Expression Data Based on Class Preserving Projection[J]. Acta Electronica Sinica, 2012, 40(2): 358-364.
王文俊. 基于类别保留投影的基因表达数据特征提取新方法[J]. 电子学报, 2012,40(2):358-364. DOI： 10.3969/j.issn.0372-2112.2012.02.024.

WANG Wen-jun. New Method of Feature Extraction for Gene Expression Data Based on Class Preserving Projection[J]. Acta Electronica Sinica, 2012, 40(2): 358-364. DOI： 10.3969/j.issn.0372-2112.2012.02.024.

摘要

从两两样本的类别关系出发

提出一种新的线性鉴别特征提取方法

叫做类别保留投影.相比经典的fisher线性鉴别分析方法

类别保留投影具有最优子空间维数不受样本类别数限制、计算复杂度低的优点.通过对真实基因表达数据进行样本分类识别

证实了本文方法的有效性.并将类别保留投影方法推广到非线性空间

提出核类别保留投影

用于解决非线性特征提取问题

对基因表达数据的实验验证了方法的可行性.

Abstract

A new method of discriminant feature extraction

called Class Preserving Projection (CPP)

is proposed from the point view of class relation of pairwise samples.Compared to LDA

CPP has the following two advantages.One is that the optimal subspace dimension is not restricted to the number of categories of samples

and the other is that computational complexity is lower.Experiments are performed on gene expression data for sample classification

and the results confirm the effectiveness of the method.Kernel CPP (KCPP) is presented by generalizing CPP to nonlinear space to solve the problem of nonlinear feature extraction

and the experiments on gene expression data verify the feasibility of the method.

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